Grundläggande molekylmodellering
Om utbildningen
I kursen Grundläggande molekylmodellering lär du dig grunderna i molekylmodellering. Fokus ligger på molekylmekanik, den lämpligaste metoden för att studera stora biokemiska system, exempelvis proteiner eller DNA, under realistiska förhållanden. Som en del inom datorbaserad biokemi lär du dig också att använda olika metoder för att till exempel studera hur ett läkemedel binder till sin målreceptor eller hur du kan använda beräkningsmetoder för att undersöka och visualisera molekylers rörelser.
Ett viktigt inslag i kursen är datorlaborationerna, där du utför olika uppgifter inom molekylmodellering med hjälp av programpaketen Molecular Operating Environment (MOE) och Chimera. I kursen ingår också ett beräkningskemi-projekt där du tillsammans med en annan student genomför en kortare studie. Några exempel är
- att docka en serie föreslagna läkemedel till en receptor för att bestämma vilken som skulle binda bäst
- att undersöka växelverkan mellan olika proteiner i ett större komplex.
Projektet redovisar du sedan som en skriftlig rapport och ett föredrag. Både rapport och föredrag utgör kursens examination.
Färdigheterna du får på kursen ger dig en bättre förståelse för molekylers struktur och för hur de växelverkar med varandra. Du får en inblick i verktyg som används inom utveckling av nya läkemedel och material samt inom forskning i biokemi.
Behörigheter och urval
Förkunskapskrav
Avslutade och godkända kurser inom det naturvetenskapliga fältet om 90 hp (eller 120 hp inom farmaci/medicin). Genomgången kurs KEM040, Fysikalisk kemi (15 hp), alternativt FYP203, Kvantfysik A (7,5 hp) eller motsvarande kunskaper, samt kunskaper motsvarande minst MMGK11, Naturvetarmatematik A1 (15 hp) rekommenderas.
Urval
Högskolepoäng, max 165 hp.
Efter studierna
Kursen kan ingå i
- Kandidatprogrammet i kemi
- Masterprogrammet i kemi
- Masterprogrammet i organisk kemi och läkemedelskemi
- Masterprogrammet i kemi och lärande
Du kan även läsa den som fristående kurs.
De färdigheter du får genom kursen i grundläggande molekylmodellering hjälper dig att bättre förstå hur du kan utveckla nya läkemedel eller hur du kan studera växelverkan som styr signalvägar i celler eller mellan proteiner och DNA. Metoderna du lär dig i kursen kan du använda inom alla områden av kemin, exempelvis materialkemi, atmosfärskemi och organisk syntes. Efterfrågan efter kunskaper inom datormodellering ökar ständigt i kemins värld.
Så är det att plugga
Undervisningen
Undervisningen består av föreläsningar, datorlaborationer och projektarbeten.
Lokaler
Du läser kursen på Campus Medicinareberget.
